С 2006 года - главный тренер сборной России (игроки 1992 г.р.) по футболу. До назначения на эту должность Смольянинов помогал готовить олимпийскую команду России, работал в раменском «Сатурне», казахстанском «Востоке», в 2001 - в нижегородском «Локомотиве», два сезона Юрий Алексеевич провел в московском «Торпедо-ЗИЛ»